技术优势
微流体芯片平台
µParaflo®技术将高通量平行合成技术,微流体技术以及数字光化学合成定制芯片技术合为一体,可为用户出具相比于传统点样芯片更为可靠和准确的表达谱数据。
主动式动态杂交反应
基于µParaflo®微流体芯片技术,彻底改变了常规芯片被动式静态杂交反应过程,取而代之的是主动式动态杂交过程,使得杂交保持高度均一性。
最新最全的探针信息
联川生物始终是全球首家提供100%覆盖最新版miRBase数据库miRNA芯片检测服务的公司。
探针序列高度灵活
采用捕获效率更优异的Agilent Human SureSelect V6 kit(58M)进行外显子组捕获。
用户发表文章最多
用户已累计发表超过600篇miRNA研究文章。这些文章发表在包括Cell、Nature、Science系列在内的众多高水平学术期刊上。
芯片信息
依托µParaflo®微流体定制化芯片技术,我们可为您提供最新版miRBase报道的任意单个物种(如人,大鼠,小鼠,水稻,玉米,斑马鱼,家蚕等)或是物种组合(如哺乳动物集,植物集,鱼类集,昆虫集等)的miRNA表达谱检测。
技术路线
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样本RNA制备及检测
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标记
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杂交
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图像获取
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数据分析
分析内容
1.差异表达的microRNA列表
2.统计学分析(含P- value和差异倍数)及聚类分析。
样本类型
细胞,组织,全血,血清,血浆,总RNA等
建议总RNA起始量:5 ug 最低 1 μg,浓度:≥100 ng/μL。
近期用户文章
1. Xie H, Zhao Y, Zhou Y, Liu L, Liu Y, Wang D, Zhang S, Yang M. (2017) MiR-9 Regulates the Expression of BACE1 in Dementia Induced by Chronic Brain Hypoperfusion in Rats. Cellular Physiology and Biochemistry 42(3), 1213-1226.
2. Quan Y, Wang Z, Gong L, Peng X, Richard MA, Zhang J, Fornage M, Alcorn JL, Wang D. (2017) Exosome miR-371b-5p promotes proliferation of lung alveolar progenitor type II cells by using PTEN to orchestrate the PI3K/Akt signaling. Stem Cell Research & Therapy 8(1), 138.
3. Wang Y, Du J, Niu X, Fu N, Wang R, Zhang Y, Zhao S, Sun D, Nan Y. (2017) MiR-130a-3p attenuates activation and induces apoptosis of hepatic stellate cells in nonalcoholic fibrosing steatohepatitis by directly targeting TGFBR1 and TGFBR2. Cell Death & Disease 8(5), e2792.
4. Wang Y, Wu S, Yang Y, Peng F, Li Q, Tian P, Xiang E, Liang H, Wang B, Zhou X. (2017) Differentially expressed miRNAs in oxygen-induced retinopathy newborn mouse models. Mol Med Rep 15(1), 146-152.
5. Lukiw WJ, Rogaev EI. (2017) Genetics of Aggression in Alzheimer’s Disease (AD). Frontiers in Aging Neuroscience 9(1), 87.
案例展示
微生物侵染促进CRC癌细胞增殖和癌症发展
世界范围内约20%的癌症与病原菌感染相关。具核梭杆菌可以刺激上皮细胞转变为癌细胞导致癌症发生,但是此过程的具体发生机制是未知的。具核梭杆菌、大肠杆菌、 PBS分别处理HCT116和LoVo 细胞,发现具核梭杆菌处理明显促进两种肿瘤细胞系细胞增殖;具核梭杆菌处理的细胞在小鼠体内形成的肿瘤组织直径更大、更重。具核梭杆菌和PBS分别灌胃APC突变小鼠,具核梭杆菌灌胃的小鼠具有更多的腹腔积液、出现血性腹泻、肠道扩张和脾肿大症状,同时存活时间更短。解剖各组小鼠发现,小鼠肠道癌组织的数量更多,直径更大,同时癌细胞内增殖细胞核抗原表达上升血清炎症因子含量升高。具核梭杆菌和PBS分别分别处理四种结直肠癌细胞(CRC)系,miRNA芯片共鉴定102个差异表达miRNA,其中miR21差异最明显。细胞内敲低miR21表达后(miR21 inhibitors),细胞增殖和迁移能力受到抑制。通过多个数据库预测并结合荧光素酶报告基因实验,发现miR21的新靶基因RASA1。具核梭杆菌和PBS分别分别处理HCT118,KEGG 和 Reactome通路分析TLR4/MYD88/NFkB通路显著富集。并且NFkB亚基(P65、P50)磷酸化程度升高,TLR、 MYD88基因表达升高。沉默TLR4或MYD88可抑制NFkB的激活状态。
生信分析表明miR21编码基因上游启动子区具有NFkB转录因子结合位点:敲低P65可降低miR21表达;转录因子结合序列人工突变后miR21表达受影响;Chip表明miR21启动子区NFkB转录因子显著富集。具核梭杆菌侵染细胞后,依次激活TLR4/MYD88/NFkB通路,NFKB是转录因子信号通路,NFKB亚基P65亚基磷酸化并结合到miR21编码基因启动子区域,促使miR21转录。高表达的miR21与RASA1结合,抑制其抑癌基因功能,促进癌细胞增殖、迁移,加速癌症发展进程。
参考文献
Yang YZ,et al. (2017)Fusobacterium nucleatum Increases Proliferation of Colorectal Cancer Cells and Tumor Development in Mice by Activating Toll-Like Receptor 4 Signaling to Nuclear FactorLkB, and Up-regulating Expression of MicroRNA-21. Gastroenterology. 152:851–866.