DirectDIA

DirectDIA（direct Data-independent acquisition），即DDA-free DIA（dDIA），与传统DIA分析策略相比，不用再进行DDA分级建库，利用机器深度学习实现直接通过搜索DIA原始文件谱图生成库。深度学习打分寻找谱峰碎裂规律，预测保留时间，去除假阳性结果。改进后的这种方式提高了效率，降低了成本，保留了DIA可重复的定量的优势，鉴定到的蛋白数目与传统DIA的差距也越来越小。